В исторической справке говорится: "В одном из документов ЦГИА, относящемся к 1734 году, было обнаружено следующее сообщение: «В прошлом 1733 году мая 13 дня прости мы каменное здание вместо церкви Живоначалъныя Троицы деревянного здания, которая весьма обветшала, и по тому нашему прошению дан указ Его Преосвященства, что вместо оной старой деревянной церкви вновь церковь Божию на том же месте, где на удобных местах по церковному чиноположению заложить, и она церковь Божия по силе вышереченного господина Ея Императорского Величества указу заложена нижняя церковь Божия, храм во имя св. блгвв. кнн. Бориса и Глеба, построена и ко освящению приготовлена» (ЦГИА, ф.796, оп.15, д.363).
Таким образом, точной датой начала строительства каменной церкви Святой Троицы на месте обветшавшей деревянной следует считать 1733 г. В «Описании курского наместничества» С. Ларионова приводится иная дата строительства каменной церкви - 1742 год. Другие источники называют годом освящения Нижне-Троицкого храма 1740 г.
Курские специалисты пишут о нем следующее: «Церковь построена в традициях русского зодчества второй половины XVII века. Храм кирпичный двухэтажный, одноглавый, по типу восьмерик на четверике. Приделы: северный - 1829 г., южный - 1842 г., на ширину четверика, подобно алтарю, имеют очертания в плане из трех дуг и сомкнутое полусводчатое покрытие. Двухуровневая трапезная соединяет храм с высокой четырехъярусной, восьмигранной на четверике, колокольней. Средний неф первого этажа и западный вход с перспективным порталом и двумя маленькими окошками по сторонам его являются, вероятно, фрагментом существовавшей здесь в конце XVII века одноименной церкви. В верхний храм ведут две крутые широкие лестницы в северной и южной пристройках к колокольне. Храм отличается скромным декоративным убранством, в основе которого - профилированные наличники и простые аркатурные фризы» (Е.В. Холодова, В.И. Склярук)".
Все последние годы в храме велись ремонтно-восстановительные работы. И вот сегодня настал радостный момент для всех православных курян - состоялось освящение сразу трех обновленных престолов.
Митрополиту Курскому и Рыльскому Герману сослужили настоятель протоиерей Александр Нечукин и клирики храма, протоиерей Александр Филин, протоиерей Василий Жданов, клирики Знаменского собора. 
По окончании богослужения митрополит Курский и Рыльский Герман поздравил всех собравшихся с радостным, торжественным событием. Владыка Герман отметил: «Сегодня мы совершили чин освящения трех новых престолов этого старинного и величественного храма. Некоторое время в этом верхнем храме не совершались богослужения, потому что проходил большой ремонт и заменялся пол и святые престолы. Они были сдвинуты с места. И вот, после ремонта, вновь состоялось освящение, обновление новых престолов, которые утверждены и будут стоять до скончания века.

Алтарь – самое главное место в храме, а в алтаре это святой престол, который символизирует нам престол Царя Небесного. На святом престоле совершается святейшее Таинство Евхаристии Тела и Крови Христовых. Святые Дары претворяются в Тело и Кровь Христовы и преподносятся верным для Причащения, для соединения с Господом и Спасителем нашим Иисусом Христом во исцеление души и тела и в жизнь вечную.
Сегодня мы освятили все три престола. Главный – в честь Святой Троицы, боковые – в честь святителя Николая и Трех Святителей. Во время освящения престолы утверждаются, омываются водой, розовой водой с вином, отираются, помазуются святым миром, облачаются в священные одежды. В основании престолов полагается частица святых мощей как память того, что святая Церковь утверждалась проповедью святых Апостолов и страданиями и кровью святых мучеников, которым мы должны подражать в вере и терпении. Мы просим и уповаем на их святые молитвы. Поэтому сегодня – памятный день обновления этого святого храма.
Сегодня также день памяти преподобного Даниила Столпника, который нес особый подвиг столпничества.  Мы знаем имена других столпников. Симеон Столпник, память которого совершается 14 сентября. Святые подвизались на Ближнем Востоке, в пределах Сирии, где сейчас такая напряженная обстановка, столь много страданий, идет война.
Столпники для подвигов избирали высокий столп. Даже не гору, а возвышение, на котором едва можно было уместиться. И день и ночь молились, стоя на коленях. Молились Богу и под палящими лучами южного солнца, и в голоде, непрестанно пребывая в молитве. Их подвиги превосходили человеческие силы и всякое разумение. Они были подобны пламени свечи. Свеча стоит, как столп, а они – как огонь. Стояли непрестанно и молили Бога о себе и о мире. Множество людей исцелялись по их святым молитвам, укреплялись в вере и добродетели, взирая на подвиг, который они совершали ради Господа, ради спасения своей души, ради будущей вечной жизни, к которой все мы призваны, живя здесь на земле. Мы не должны забывать о жизни вечной для бессмертной своей души.
Для этого и созданы святые храмы. Ведь Господь, престол которого – небо, земля – подножие ног Его. Он не нуждается в нашем угождении. Ему служат сонмы ангелов. А храмы Божии – это для нас. Чтобы  мы в них просвещались, освящались, молились, соединялись с Господом, каялись, становились лучше, становились ближе к Богу. Поэтому будем любить храм Божий и дорожить каждым часом, каждой минутой пребывания в Дому Божием.
Я радуюсь тому, что сегодня служил с Вами Божественную литургию, и мы освятили престолы этого храма. Дай Бог, чтобы храм, который любят жители нашего града, всегда наполнялся народом, и в нем совершались благоговейные богослужения. Чтобы этот старинный и величественный храм был подобен кораблю, плывущему по житейскому морю в пристанище Царствия Небесного.
Храни всех Вас Господь Своей благодатию и человеколюбием!»
Духовенство Курской митрополии, прихожане и гости храма поздравили Главу митрополии с днем рождения и пропели «Многая лета!».
Затем в епархиальное управление поздравить митрополита Курского и Рыльского Германа пришли руководство и представители областной и городской администраций, Курской областной Думы, руководители предприятий и организаций, а также управляющие Щигровской и Железногорской епархией - епископ Паисий и епископ Вениамин. Владыка Вениамин вручил митрополиту Курскому и Рыльскому медаль Державной иконы Божией Матери I степени за №1 от 24.12.2015 "за церковные заслуги перед Железногорской епархией".