В 1883 году курский купец Дмитрий Сазонов оставил по духовному завещанию в пользу Свято-Троицкого монастыря 20 десятин земли в 7 верстах от Курска. Холмистое, покрытое лесом, это место было совершенно пустынно. Заботами настоятельницы игумении Софиив 1890 г. была выстроена каменная холодная церковь с такою же колокольнею в память избавления Государя Императора Александра III и его августейшей семьи от грозившей им опасности при крушении поезда 17 октября 1888 года на ст. Борки Курско-Харьковско-Азовской железной дороги.
 В 1901 году игумения София, заботясь о призреваемых в скиту старицах, а также о сестрах, поселившихся здесь на постоянное жительство, число которых увеличилось до 80 человек, ходатайствовала перед преосвященным Лаврентием о постройке теплой церкви. Получив разрешение, игумения приступила к постройке, и церковь была торжественно освящена 25 сентября 1903 года в память посещения Курска Императором Николаем Александровичем во время маневров 1902 года.
 После революции 1917 года скит блгв. кн. Александра Невского постигла участь всех монастырей Русской Православной Церкви.
18 января 1925 года была создана комиссия, которая описала имущество и личные вещи монахинь. В кельи предприимчивый комендант Соклаков заселил дачников из города, вынудив монахинь жить на чердаках своих собственных домов.
Монастырь был закрыт последним в Курской губернии, но жизнь его не оборвалась. Монахини жили в миру и молились о восстановлении обители.

Новая история обители
25 августа 2002 года по инициативе настоятельницы Курского Свято-Троицкого женского монастыря монахини Серафимы (Коноваленко) с благословения митрополита Ювеналия протоиереем Григорием Машлякевичем был отслужен молебен около развалин храма во имя св. блгв. кн. Александра Невского, после чего состоялся крестный ход на источник, который был освящен в честь св. блгв. кн. Александра Невского и установлен поклонный крест.
2 января 2003 года указом митрополита Курского и Рыльского Ювеналия в Шуклинку была направлена монахиня Серафима Коноваленко для восстановления вышеуказанного монастыря.
Восстановление любой обители должно начинаться с молитвы, поэтому с разрешения руководства завода «Счетмаш» удалось организовать временный храм в здании строящегося профилактория.
28 сентября 2003 г. начато строительство храма во имя святителя Николая Чудотворца. Восстановить храм на том месте, где он был освящен в 1903 г. в соответствии со страховой описью 1911 г. и другими архивными документами, было невозможно из-за построенного профилактория.
1 августа 2004 г. в недостроенном храме был отслужен первый молебен, после чего по воскресениям начались богослужения и параллельно достраивался храм.
В апреле 2005 г. начато строительство трапезной.
По инициативе председателя секции кавалеров ордена св. блгв. кн. Александра Невского Валентина Степановича Барышева был создан попечительский совет, в который вошли руководители Курской региональной организации партии «Единая Россия». Его возглавил депутат Государственной Думы Валерий Рязанский.
14.08.2007 г. архиепископом Курским и Рыльским Германом был отслужен молебен на начало восстановления храма во имя св. блгв. кн. Александра Невского. Проект реставрации старинного храма разработали специалисты творческой мастерской архитектора Валерия Михайлова.
24 июня 2010 г. на колокольне возрождающегося храма были установлены пять колоколов, пожертвованных А.Д. Коштояном и один колокол ХIХ века, пожертвованный О.М. Радиным. Над Шуклинкой, впервые за последние сто лет, прозвучал колокольный звон.
В сентябре 2010 г. были привезены купола из г. Волгодонска, изготовленные фирмой «Грант».
21 октября 2010 г. после молебна, совершенного архиепископом Курским и Рыльским Германом, купола с крестами были установлены.
В 2011 г. в апреле, накануне Пасхи, на колокольне храма свт. блгв. кн. Александра Невского был установлен колокол весом 230 кг, пожертвованный благотворительницей обители Зинаидой Степановной Донченко.
19 июня 2012 г. архиепископ Курский и Рыльский Герман совершил чин освящения престола восстановленного старинного храма. В этот памятный день в дар храму депутат Государственной Думы РФ Александр Брыксин передал ковчег с частицей мощей свт. блгв. кн. Александра Невского. Это было поистине высшей наградой для всех, кто участвовал в восстановлении этого великолепного храма.