С конца XVII века в Курске существовали богоугодные заведения приказа общественного призрения, занимавшие огромную усадьбу в квартале улиц Садовой и Семеновской. В 1830 году в больничном корпусе была построена и освящена Скорбященская церковь, а при ней позже выстроена часовня. Сведения о ней находятся в документах Государственного архива Курской области. Эта часовня упоминается, в частности, как действующая в ведомости о Скорбященской церкви при губернской земской больнице за 1916 год. В 1930-ые годы здание было лишено главы.

До 2004 года здание часовни относилось к строениям городской больницы №1.

2 января 2004 года по благословению митрополита Курского и Рыльского Ювеналия, была образована православная община в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» с целью возвращения и восстановления этого храма.

6 февраля 2004 года община была зарегистрирована в органах юстиции. 23 июля 2004 года комитет по управлению имуществом передал в безвозмездное бессрочное пользование новообразованной общине здание бывшей часовни.

29 июля 2004 года указом митрополита Курского и Рыльского Иувеналия настоятелем прихода в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» был назначен священник Вадим Санин.

В августе 2004 года митрополитом Иувеналием был освящен антиминс для совершения литургии в храме в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость».

Первое богослужение было совершено на праздник Преображения Господня.

6 ноября 2007 года храм был освящен архиепископом Курским и Рыльским Германом.